San Juan de Ortega fue un religioso español, discípulo del santo Domingo de la Calzada. Dedicó su vida a atender a los peregrinos que realizaban el Camino de Santiago. Contruyó albergues y Monasterios. Pero sin duda su labor más conocida es la construcción de una Iglesia dedicada a San Nicolás de Bari en la localidad de San Juan de Ortega (Burgos), donde se celebra todos los años la célebre romería de San Juan de Ortega.
Desde 1971 es patrón de los aparejadores de España.
Nació en Quintanaortuño, (Burgos), en el seno de una familia acomodada. Fue discípulo de santo Domingo de la Calzada con quien realizará una de las mayores empresas de la Edad Media. Junto a su maestro intentó mejorar el paso de los peregrinos, sirviéndose de sus conocimientos para la construcción. Se dice de Juan que fue el arquitecto más famoso de Castilla.
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En 1431 se encontraba en muy mal estado, habitándolo tan solo tres monjes. Fue entonces cuando el obispo de Burgos, Pablo de Santa María, ordenó que fueran los monjes jerónimos del Real monasterio de Nuestra Señora de Fresdelval los que lo habitasen, permaneciendo estos hasta la desamortización de 1835, cuando los bienes del monasterio fueron vendidos en subasta pública.
En 1931 fue declarado monumento nacional. Su primitivo sepulcro románico se encuentra en la iglesia de San Juan de Ortega.
En los dos equinoccios (21 de marzo y 22 de septiembre), un rayo de sol que se introduce por un ventanal ilumina a las 5 de la tarde el capitel de la Anunciación, apreciándose que la Virgen María se dirige a la luz y no a San Gabriel como es tradicional.
Mezcla de observación astronómica y técnicas arquitectónicas produce un mensaje simbólico de los constructores medievales, con quienes están muy relacionados los aparejadores y los maestros de obras, único en occidente.